腰椎小关节功能紊乱综合征的患者在临床上还需要和也表现为椎旁压痛、晨僵、下腰痛的强直性脊柱炎相鉴别。强直性脊椎炎（AS）是一种慢性的，渐进的炎性风湿性主要涉及骶髂关节和中轴骨骼的疾病。其主要临床特点是腰背部疼痛和脊椎逐渐僵硬。臀部和肩膀的寡关节炎，起止点病和前葡萄膜炎常见，而心脏和肺部受累少见。对这种疾病发病机制的认识目前仍有限。尽管在过去的三十年里大量报道显示人类白细胞抗原B27（HLA-B27）和强直性脊柱炎的易感性存在较强关联，但HLA-B27在强直性脊椎炎和其他脊柱关节病中的确切致病作用仍有待确定。有学者对过去几十年有关强直性脊椎炎病理机制的文献进行了回顾，认为强直性脊柱炎是一种多基因遗传疾病，HLA-B27在其发病的病理机制中发挥重要作用。 有关HLA-B27的免疫生物学的动物实验研究对HLA-B27的致病作用提供了深入了解。对于支持“关节炎基因肽”假说的抗原肽的寻找一直令人失望。在过去十年中，对炎症反应的调解中重链HLA-B27的错误折叠和未折叠蛋白反应的重要作用的研究兴趣不断增。尽管对强直性脊椎炎发病机制的认识近几年已经有了很多新发现，但其确切的机制还有待确定。有相当乐观，认为其他的易感基因，诱发因素，和炎症调质将被确定，为今后该病的治疗将提供更多途径。

    专家告诉我们，虽然目前我们对于强直性脊椎炎尚无有效治疗方法，但从腰椎小关节病变的角度去理解该病，有针对性地实施介入治疗，可以在一定程度上减轻患者的疼痛，提高患者的生存质量。